En 1783, Roi de Kartli-Kakheti (région du sud-est de la Géorgie moderne),  Irakli II, attribue au prince Garsevan Chavchavadze (1757-1811) des domaines viticoles à Kakheti pour les services rendus au royaume lors de la signature du traité de Georgievsk, un accord d’amitié qui plaçait la Géorgie sous  protectorat de la Russie. Les vignobles Zegaani faisaient partie des terres données.

En 1811, à l'âge de 26 ans, le fils de Garsevan Chavchavadze, Alexandre (1786-1846), hérita de la succession après le décès de son père. Depuis 1812, Alexander est activement impliqué dans la guerre civile et les campagnes à l’étranger. Il est devenu un aide de camp de Barclay de Tolly lors du siège de Paris. Pendant cette partie de sa vie, Alexander Chavchavadze, filleul de Catherine la Grande, a eu l'occasion d'explorer les modes de vie, l'architecture, la culture et les traditions allemande et française de ces pays européens. Il s'est également familiarisé avec les particularités de la viticulture et de la vinification européennes, dont certains ont ensuite été adoptées en Géorgie.

Avant le retour d'Alexandre Chavchavadze dans son pays d'origine en 1817, le vin géorgien était élaboré à l'aide de la technologie locale traditionnelle de Kakheti et les nombreux vignobles n'étaient pas divisés par des microrégions. Ainsi, la majorité des historiens et des archéologues s'accordent à dire que, malgré le fait que l'industrie du vin existe en Géorgie depuis 7000-8000 av. J.-C., la culture de la vinification est venue d'Europe en Géorgie et son fondateur était Alexander Chavchavadze - également fondateur du Château Zegaani.

En 1820, la construction des domaines viticoles d’Alexander Chavchavadze à Kakheti est achevée, comme en témoignent les mémoires du consul de France à Tiflis, Jacques François Gamba (1763-1833). Dans ses mémoires, il souligne les similitudes évidentes entre le domaine et les jardins du prince Chavchavadze et les bâtiments européens du XIXe siècle. Le parc où se trouve le château Zegaani est parfaitement préservé à ce jour.

Après la mort du prince Alexandre Chavchavadze en 1846, c’est son fils, David Alexandrovich Chavchavadze qui hérita le domaine.

En 1854, l'imam Shamil lance une autre attaque sur la Kakhetie, en Géorgie. Il a envoyé une avant-garde qui a pris d'assaut le domaine familial du prince David Chavchavadze - Tsinandali, situé à 65 km de Tiflis (Tbilissi moderne). Anna Ilyinichna Bagration-Gruzinskaya, l’épouse du Prince, âgée de 28 ans, et ses 6 jeunes enfants  ont été enlevés ainsi que sa soeur, la princesse Varvara Orbeliani, âgée de 26 ans qui y passait ses vacances, avec un fils âgé de six mois; La nièce de Varvara, la princesse Nina Baratova, âgée de 18 ans; et la gouvernante française des enfants, Mme Anna Drancey.

Malheureusement, lors de cet enlèvement perfide, le domaine de Chavchavadze à Tsinandali a été complètement incendié (il a ensuite été restauré et abrite maintenant le musée du prince Alexandre Chavchavadze). L'imam Shamil a demandé au prince David de payer une rançon d'un million de roubles à ses captifs. Le prince David Chavchavadze fut contraint de faire appel à l'empereur de Russie Nicolas Ier (1796 - 1855) pour lui emprunter cette somme afin de payer la rançon pour libérer sa famille. Les prisonniers ont été rachetés de Shamil indemnes, mais en conséquence, le domaine de la famille Chavchavadze a finalement été transféré pour rembourser la dette en 1886 à l'empereur russe Alexandre III (1845 - 1894), et appartenait aux Romanov jusqu'à la révolution 1917. Il existe de nombreuses preuves documentaires de cette période qui confirment l'amour de l'empereur russe Alexandre III pour les vins de Kakhetie.

Au cours de la période dite "soviétique" de l'histoire géorgienne, qui a débuté en 1922, le développement de la vinification géorgienne dans le sens européen a été suspendu. Ceci, à son tour, a considérablement réduit les limites de la répartition géographique. Malheureusement, cette tendance s'est poursuivie au cours des premières années de la période postsoviétique.

Depuis 1998, le Château Zegaani appartient à la famille géorgienne Tatulashvili et aux vignobles.

Aujourd'hui, dans l'enceinte du château viticole du XIXe siècle, unique en Géorgie, les vins sont produits à partir des récoltes des vignobles locaux, comme ils l'étaient il y a des centaines d'années. À ce jour, ils sont entreposés dans les caves du prince Alexandre Garsevanovich Chavchavadze.